FIMO HTML报告中SVG描边粗细等样式参数不可配置，因其由MEME Suite源码硬编码固定为stroke-width:1，无命令行选项支持；需通过后处理SVG或换用seqlogo/logomaker等工具自定义。
FIMO HTML输出不包含描边粗细等SVG样式参数
FIMO 本身不生成带内联描边（stroke-width）、颜色（stroke）或其它 SVG 样式属性的 HTML 报告——它只输出基础 HTML 表格 + 嵌入的 SVG 图形，而这些 SVG 是由 MEME Suite 内部硬编码生成的，**没有暴露描边控制接口**。
描边粗细由 MEME Suite 的 SVG 模板固定写死
查看 FIMO 输出的 HTML 中的 片段，你会发现所有 motif logo 的矩形/字母路径都使用类似 stroke:#000;stroke-width:1 的固定值。这个值来自 MEME Suite 源码中的 SVG 渲染模板（如 src/meme-suite/src/meme/meme.c 或 src/meme-suite/src/meme/html.c），无法通过命令行参数或配置文件修改。
- FIMO 自身无
--stroke-width或--svg-style类参数 -
fimo --html的输出完全依赖底层meme-chip或motif-logo渲染逻辑 - 即使手动编辑 HTML 中的 SVG，改了
stroke-width也仅影响当前页面，不改变 FIMO 运行时行为
想自定义描边？只能后处理 SVG 或换工具链
如果必须调整描边，可行路径只有两个：
- 用脚本批量解析 FIMO 输出 HTML 中的
，用正则或xml.etree.ElementTree替换所有stroke-width="1"为所需值（例如stroke-width="2"） - 跳过 FIMO HTML，直接用
fasta-get-markov+mast或tomtom输出 BED/TXT，再用seqlogo（R）或logomaker（Python）重绘 logo —— 这些工具支持显式传入stroke_width、line_width等参数 - 注意：FIMO 的
--oc输出目录里有原始.txt和.bed，它们才是可编程加工的源头，HTML 只是展示快照
容易被忽略的关键点
FIMO 的 HTML 报告本质是「只读快照」，不是可配置的渲染引擎。描边、字体、间距、配色全部固化在 MEME Suite 的 C 代码里；哪怕你升级到最新版 MEME Suite，只要没改源码重新编译，stroke-width 就还是 1。真要定制视觉效果，得从数据层（BED/TXT）出发，而不是修 HTML。
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