在linux系统中，生物软件的运行需要实时监控其状态，包括cpu和内存使用情况。当出现错误时，能够及时终止任务，并进行前后台切换和暂停操作是非常重要的。
本文将介绍一些关键命令，帮助您更好地管理Linux系统中的进程。
1 查看进程
进程查看可以使用top和ps命令。其中，top命令可以动态查看进程状态，而ps命令则提供静态快照，方便其他程序捕获和处理结果。
Linux系统中，进程的状态包括运行（R）、中断（S）、不可中断（D）、僵死（Z）和停止（T），每种状态都有其特定的含义。
命令：top
top命令可以动态显示系统进程的使用情况，类似于Windows系统的任务管理器。它可以显示当前系统正在执行的进程的相关信息，包括进程ID、内存占用率和CPU占用率等。
top #按 "q" 退出，查看系统运行状态 top -b #按 "Ctrl + C" 退出 top -c top -u "yourname"
top命令结果详解：
| 内容 | 释义 |
|---|---|
| USER | 进程的所有者 |
| PID | 进程ID号 |
| %CPU | 运算器占用率 |
| %MEM | 内存占用率 |
| VSZ | 虚拟内存使用量（KB） |
| RSS | 固定内存使用量（KB） |
| TTY | 所在终端 |
| STAT | 进程状态 |
| START | 被启动的时间 |
| TIME | 实际使用CPU的时间 |
| COMMAND | 命令名称与参数 |
命令：ps
ps命令是另一个重要的进程管理工具，它可以显示某一时刻的进程快照。
ps -aux #显示进程信息，包括无终端的 ps -ef #显示所有进程信息，连同命令行 ps -aux --sort -pcpu | less #根据CPU使用升序排序 ps -aux --sort -pmem | less #根据内存使用升序排序 ps -aux --sort -pcpu,+pmem | head -n 10 #显示消耗CPU和内存前十名的用户
2 前后台切换
在Linux中，可以通过以下命令进行任务的前后台切换：
前后端完整代码包括本馆动态，新书来了，书籍榜单，服务指南，进馆预约，活动讲座预约等功能，采用腾讯提供的小程序云开发解决方案，无须服务器和域名 预约管理：开始/截止时间/人数均可灵活设置，可以自定义客户预约填写的数据项 预约凭证：支持线下到场后校验签到/核销/二维码自助签到等多种方式详尽的 预约数据：支持预约名单数据导出Excel，打印
& #命令行任务放到后台 sleep #休眠一定时间 jobs #查看后台进程 fg #切换到前台程序 bg #切换到后台程序 ctrl+z #暂停任务 ctrl+c #终止任务
案例：
#1 后台运行200秒 sleep 200 & sleep 300 & #2 查看任务 jobs #3 任务1切换到前台 fg 1 #4 切换到后台 ctrl+z暂停；bg 1；切换到后台运行； #5 任务2切换到前台并杀掉 bg 2 ctrl+c
3 任务管理
3.1 nohup 非挂起
nohup命令可以让程序在忽略挂起信号的情况下运行，输出信息不会显示到终端，而是附加到nohup.out文件中。
nohup sh scripts.sh &
3.2 切换为非挂起 disown
disown命令可以从当前shell的作业列表中移除作业，使其在shell退出后继续运行。
-h #标记作业，不接收SIGHUP信号 -a #移除所有作业 -r #移除运行中的作业
3.3 杀死任务 kill
kill命令用于终止进程，可以发送指定的信号给进程或工作。默认信号为15，如果进程忽略此信号，可以使用信号9强制终止。
kill -9 12000
4 screen
screen是一个全屏窗口管理器，可以在多个进程之间多路复用一个物理终端。使用screen可以创建多个窗口，每个窗口就像一个独立的终端连接。
4.1 选项参数
$ screen --help Use: screen [-opts] [cmd [args]] or: screen -r [host.tty] Options: -A：将所有的视窗都调整为目前终端机的大小。 -d：将指定的screen作业离线。 -h：指定视窗的缓冲区行数。 -m：即使目前已在作业中的screen作业，仍强制建立新的screen作业。 -r：恢复离线的screen作业。 -R：先试图恢复离线的作业。若找不到离线的作业，即建立新的screen作业。 -s：指定建立新视窗时，所要执行的shell。 -S：指定screen作业的名称。 -v：显示版本信息。 -x：恢复之前离线的screen作业。 -ls：显示目前所有的screen作业。 -wipe：检查目前所有的screen作业，并删除已经无法使用的screen作业。
4.2 快捷键
使用screen时，常用的快捷键包括：
ctrl + a，d #暂离当前会话 ctrl + a，c #在当前screen会话中创建一个子会话 ctrl + a，w #子会话列表 ctrl + a，p #上一个子会话 ctrl + a，n #下一个子会话 ctrl + a，0-9 #在第0窗口至第9子会话间切换
4.3 使用案例
利用screen不间断下载生物数据的案例：
#1 新建会话，命名为wget
screen -S wget
#2 运行命令
wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/swissprot.gz
#3 按ctrl+a，然后字母d，退出会话，任务仍在运行
$ screen -S wget
[detached from 283349.wget]
#4 screen -ls查看任务
$ screen -ls
There is a screen on:
283349.wget (Detached)
1 Socket in /var/run/screen/S-wangtong.
#5 重新进入wget终端，任务正在运行
$ screen -r wget
#6 关闭会话任务，如果在会话中使用exit，就会在退出会话，也关闭了该会话，或者按ctrl+a，k
# screen ls查看会话
$ screen -r wget
[screen is terminating]通过这些命令和工具，您可以有效地管理和监控Linux系统中的生物软件运行状态，确保其稳定运行。
