清空函数体用ary.length = 0，手机不方便，过会给你解释原因。

原因来了:
传参时, ary是[1, 2, 3]的引用(类似于指针);
改变ary的内容会反映到外面, 如arr.push(4);
但是直接覆盖ary为[]则相当于ary指向新的对象, 不再指向原来的[1, 2, 3], 但是[1, 2, 3]还在那, 即你没有对其做任何改动.

额...

1. clear = function (ary) {
ary = [];
};
你要明白，传参数传的是数值，不是参数名！这里传的是参数值[1,2,3]，不是参数名 a ，会把[1,2,3]赋值给ary，所以此时 ary = [1,2,3] ，然后给ary赋值为空数组，ary = []。a 还是原来的值，并没有改变

2.console.log(a); 这里的 a 依然还是全局变量中的 a

可以F12 运行下下面的代码：

var clear = function (ary) {
    console.log(ary); //输出：[1,2,3]     
    ary = [];
    console.log(ary); //输出：[]  
    console.log(a); //输出：[1,2,3]  
};
var a = [1, 2, 3];
clear(a);
console.log(a); //输出：[1,2,3]  

解释为什么修改成 ary.length = 0;后数组a 也会变成空数组，而 ary = [ ]不会有影响。

上面也通俗的讲了传参的是数值，准确地讲是JS中所有的函数都是按值传递的，不论这个参数是基本类型的还是引用类型的。
基本类型的参数比较好理解，相当于函数的局部变量，在函数体内修改参数不会影响函数外部的变量。
如果是引用类型，此题就是，这个数组对象 a 被传递到clear函数中之后复制给了ary,在这个函数的内部，ary和a 引用的都是同一个对象，所以在函数内部改变这个引用对象的属性的时候，函数外部的a也会相应的改变。
好，现在要捋一捋ary.length = 0;和 ary = [ ] 这两种清空数组的方式的区别了，简单来说，前者保留了数组对象的其他属性，而后者没有，因为其实它并不能说是严格意义的清空数组，只是将ary重新赋值为空数组，与 a 没有半毛钱关系了，所以如果之前的数组没有引用在指向它，将等待垃圾回收。
所以，如果是ary = [ ]，此时ary和a引用了不同的对象，则对 数组 a 没有影响，如果是ary.length = 0;因为ary和a依然引用同一对象，所以修改了ary后也会反应到a上。

不知道有没解释清楚。

一旦用了=给ary赋值，这就是一个新的数组了(对象也是同理)
要清空数组，
你可以通过改变数组的length属性，如ary.length = 0,
或则使用操纵当前数组的方法，如ary.splice(0,ary.length)
总之不要产生新的数组，

ary.length = 0

其实就是JS对象的基本知识，传值传的是对象的引用，而JS中数组也是一个对象。
所以，ary.length = 0 修改的是[1,2,3]这个数组的长度，因此能起到作用;
ary = [] 则是将[]的引用赋值给ary ，ary因此指向了[]，现在你还能指望ary修改[1,2,3]?
所以a引用的[1,2,3]并没有变化

进入函数：
ary=a;//参数值传递
这个时候：
因为a->[1,2,3];//->表示指向
所以ary->[1,2,3];
ary=[];//函数体执行
这个时候：
ary->[];
但是a->[1,2,3];//a没有改变;

太多太大段的描述，看的好累。我来精简一下：

数字，字符串等都是值类型，而 plain object，array 等都是引用类型。

给你举个栗子你立马能明白：

jsvar a = [1,2,3];
var b = a;

b.push(4);
console.log(a); // [1,2,3,4]

var num = 123;
var _num = num;
_num = 456;

console.log(num); // 123

虽不是就题论题，但思路很重要。

function clear（arry）｛
arry.length = 0；
return arry；
｝

arry.length = 0 修改的还是原来数组
arry =[] []的引用赋值给arry，而arry原来指向的数组并没有改变

a、arr都只是保存了一个地址，这个地址指向堆中的数据[1, 2, 3]，调用clear时，只是把a的地址拷贝给arr，在clear函数里面，arr = []指向了另外一个地址，但并不影响外面的a，类似的情况，请参考nodejs中module.exports与exports的区别!