FIMO的HTML不支持自定义阴影，因其渲染由硬编码的fimo_html.pl脚本完成，box-shadow值（如1px 1px 2px rgba(0,0,0,0.3)）写死在内联CSS中，命令行无相关参数，只能手动修改HTML或重绘。
FIMO 输出的 HTML 中没有可配置的阴影偏移量参数。它生成的交互式热图（如 motif 打分图）使用的是固定样式内联 CSS，阴影效果是硬编码的，不暴露给用户控制。
为什么 FIMO 的 HTML 不支持自定义阴影
FIMO 本身不负责渲染 HTML —— 它调用的是 MEME Suite 内置的 fimo_html.pl 脚本（Perl），该脚本将结果转为静态 HTML + 内联 SVG。所有视觉样式（包括 box-shadow）写死在模板中，例如：
box-shadow: 1px 1px 2px rgba(0,0,0,0.3)
这个值无法通过命令行参数、配置文件或输入 BED/GFF 修改。
FIMO 命令行输出里根本没有阴影相关选项
运行 fimo --help 或查阅官方文档，你会发现所有参数都围绕匹配阈值、输出格式（--oc, --text）、数据库（--bgfile）等，没有任何参数名含 shadow / offset / blur / css / style。
-
--html：仅触发 HTML 报告生成，不接受样式参数 -
--verbosity：控制日志级别，不影响渲染 -
--max-stored-scores：影响内存，和视觉无关
想改阴影？只能手动编辑 HTML 或重写渲染逻辑
如果你已生成 fimo.html，可以打开它搜索 box-shadow，定位到类似这行：
直接修改数值即可，比如改成
2px 4px 6px rgba(0,0,0,0.4)来增强偏移与模糊。但注意：
- 每次重新运行
fimo --html都会覆盖，需重复修改- SVG 内部的矩形（motif 区域）通常无阴影，只有外层容器有
- 浏览器兼容性没问题，但移动端可能因缩放导致阴影裁剪
真正要自动化控制阴影，得绕过 FIMO 自带 HTML，用其
--text或--bed输出，再用 Python（Plotly / matplotlib）或 R（ggplot2）重绘 —— 这时阴影、偏移、颜色全由你代码决定。相关文章
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