可通过筛选“free full text”获取开放文献，或使用scholarscope插件辅助下载，还可利用python工具批量抓取pdf。
如果您在PubMed上找到了所需的文献，但无法直接获取全文PDF，则可能是由于访问权限或资源链接的限制。以下是几种有效的途径和方法来下载PubMed文献的全文PDF文件：
一、通过“免费全文”筛选功能查找开放获取文献
此方法利用PubMed内置的筛选器，专门查找那些被标记为可免费访问的开放获取（Open Access）文章。这能有效避免因订阅权限问题导致的访问失败。
1、进入PubMed官网并输入您的检索关键词进行搜索。
2、在搜索结果页面的左侧边栏，找到“文献类型”或“文本可用性”过滤选项。
3、勾选其中的“Free full text”复选框。
4、页面将自动刷新，仅显示提供免费全文的文献记录。
5、点击您需要的文献标题，在详情页右侧的“Full Text Links”区域寻找如“Free PMC Article”、“Free full text from publisher”等链接。
6、点击相应链接跳转至全文页面，通常可以在页面上找到“PDF”或“Download PDF”按钮进行下载。
二、利用Scholarscope浏览器插件增强下载功能
Scholarscope是一款强大的第三方浏览器扩展，它能在PubMed搜索结果页直接显示期刊分区、影响因子，并集成全文下载通道，即使在校外网络环境下也可能成功获取全文。
1、访问浏览器的扩展程序商店，搜索并安装“Scholarscope”插件（支持Chrome、Edge、Firefox等主流浏览器）。
2、安装完成后，点击浏览器工具栏上的拼图图标，将Scholarscope固定以便随时使用。
3、打开PubMed网站并进行文献检索，您会发现每条搜索结果旁都新增了颜色标记的分区信息和影响因子。
4、对于有全文访问权限的文献，Scholarscope通常会在其条目附近显示一个下载图标或“PDF”链接。
5、直接点击该下载图标，插件会尝试自动定位并下载PDF文件到本地。
三、使用命令行工具实现批量下载
对于需要大量文献的研究人员，可以采用基于Python的自动化脚本工具，通过提供PMID（PubMed唯一标识符）列表来批量抓取和下载PDF全文。
1、确保您的电脑已安装Python 3.7或更高版本，可通过命令行输入python --version来检查。
2、打开终端或命令提示符，执行以下命令克隆一个开源项目：
git clone https://gitcode.com/gh_mirrors/pu/Pubmed-Batch-Download
3、进入项目目录：
cd Pubmed-Batch-Download
4、使用pip安装必需的依赖库：
pip install requests beautifulsoup4 lxml
5、运行下载脚本，指定您要下载的文献PMID：
python fetch_pdfs.py -pmids 25176136（将示例中的数字替换为您自己的PMID）
6、脚本执行完毕后，检查项目根目录下生成的“fetched_pdfs”文件夹，其中应包含以PMID命名的PDF文件。
