之前我曾分享过一个有关 qiime2 图形界面的笔记，名为《qiime2 图形界面版（q2studio）》，这是由 qiime2 团队开发的工具。然而，最近 qiime2 团队似乎转向了使用 galaxy 平台，并在 qiime 2 2021.4 版本中加入了对 galaxy 的支持。他们还发布了官方宣传和安装视频，这些视频也被转载到公众号上。虽然之前的视频没有字幕，看起来有些困难，但现在已经重新添加了中英文双语字幕并进行了校对。
https://www.php.cn/link/ac83d3f400e95a5d31e7c59d2743bf73?
今天我将分享如何在我们日常使用的 Windows 电脑上搭建一个 QIIME2 Galaxy 环境，以便愉快地进行 16S 数据分析。虽然与官方方法略有不同，但最终目标是一致的。如果你使用的是 Mac，过程会更简单，只需安装 Docker 客户端即可。
在安装 WSL2 时，请注意必须使用 WSL2，因为 WSL1 不支持 Docker。Windows Docker 可以使用，但前提是你的操作系统必须是旗舰版，相信大多数同学的电脑都是家庭版。如果你之前安装了旧版本的 WSL 且不想删除，也没关系，两个版本可以共存。好了，让我们开始吧！一位朋友已经写好了安装教程，我在这里直接转载一下：在 Win10 下同时使用 WSL1 和 WSL2 子系统，提升开发效率 (icode9.com)[1]。
打开 Ubuntu 18.04.5 on Windows，恭喜你，完成了第一步！
如红框所示，完成这些操作后，你就得到了一个标准的 WSL2。我安装的是 Ubuntu 18.05，一个非常稳定的版本。
代码语言：javascript代码运行次数：0运行复制```javascript lsb_release -aNo LSB modules are available.Distributor ID: UbuntuDescription: Ubuntu 18.04.5 LTSRelease: 18.04Codename: bionic
你可能会遇到默认软件源在国外导致下载安装软件速度慢的问题，解决方法是更换镜像源。代码语言：javascript代码运行次数：0运行复制
javascript sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.bcakupsudo vim /etc/apt/sources.list# 键盘输入以下，删除原有内容d99d# 要粘贴的内容如下deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiversedeb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic main restricted universe multiversedeb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiversedeb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiversedeb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiversedeb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse# 按ESC键退出编辑模式，键盘输入以下就可以保存啦！:wq安装 Docker 如果你不介意 Docker 的版本，只要能用就好，一条命令就能解决问题。当然，你也可以安装使用 WSL2 中的 Docker 守护进程的桌面管理程序，详见：WSL2 + Docker + xfce4 安装及使用_笔上烽烟的博客-CSDN 博客_docker wsl2[2]。
代码语言：javascript代码运行次数：0运行复制javascript
安装Dockersudo apt updatecurl https://www.php.cn/link/544d86a583c877780b83a3b31e226465 | shdocker -vDocker version 20.10.7, build 20.10.7-0ubuntu5~18.04.3 sudo service docker start
安装 q2 galaxy 代码语言：javascript代码运行次数：0运行复制```javascript sudo docker pull quay.io/qiime2/q2galaxy# 运行docker run -d -p 8080:80 -p 8021:21 -p 8022:22 -v $HOME/q2galaxy_data/:/export/ quay.io/qiime2/q2galaxy初次运行时，应该会有一个初始化的过程，等待几分钟，观察进程运行起来，CPU 占用率上升后，就可以打开浏览器访问 https://www.php.cn/link/ec25d36848f1c8eed1c6729bb73fc7f9] 愉快地使用了！
与之前印象中的 Galaxy 不同（界面像是十几年前的），现在的版本在视觉元素上有了现代化的感觉，一些公司的云平台也是基于 Galaxy 构建的。文件都存储在你的 Linux 子系统家目录下的 q2galaxy_data 文件夹中，如果没有该文件夹，会自动创建。
空间占用还是相当大的，如果你的 C 盘容量不大，需要注意一下。当然，现在很多电脑已经不分盘，直接使用 512G 的 C 盘。
开始学习吧！如有问题，欢迎交流，在我的时间允许的情况下，我愿意免费提供帮助！
参考资料[1]在 Win10 下同时使用 WSL1 和 WSL2 子系统，提升开发效率 (icode9.com): https://www.php.cn/link/37563f059c2d815bf5fc637cb88e1df3
[2]WSL2 + Docker + xfce4 安装及使用_笔上烽烟的博客-CSDN 博客_docker wsl2: https://www.php.cn/link/a352147f3aad581bed027339ac1d5dd9
[3]https://www.php.cn/link/cbb686245ece57c9827c4bc0d0654a8e: https://www.php.cn/link/cbb686245ece57c9827c4bc0d0654a8e
